Основная цель НАП заключается в объединении специалистов-полиграфологов, внедрение общепринятых этических норм и стандартов практики, повышение профессионализма практикующих специалистов полиграфологов, международное сотрудничество в области инструментальной детекции лжи и развитие науки полиграфологии.